Μοριακή ανίχνευση και επιδημιολογική συσχέτιση κλινικών στελεχών εντεροϊών στην 5'-μη κωδική περιοχή

Abstract

Οι Εντεροϊοί είναι μέλη της οικογένειας των ricorna ιών. Οι Εντεροϊοί είναι ένα γένος ιών που φέρει θετικής πολικότητας μονόκλωνο RNA [(+)ssRNA] και συνδέονται με διάφορες ασθένειες του ανθρώπου και των θηλαστικών. Το γένος των εντεροϊών περιλαμβάνει τα ακόλουθα είδη: ροϋο-ιούς. ανθρώπινους εντεροϊούς A, HEV-A, ανθρώπινους εντεροϊούς Β, HEV-B, ανθρώπινους εντεροϊούς C, HEV-C, ανθρώπινους εντεροϊούς D, HEV-D, και τουλάχιστον τρία ζωικά είδη (εντεροϊούς βοοειδών, πιθηκόμορφων, και χοίρων). Συνολικά διακρίνονται 64 ορότυποι. Όλοι περιέχουν ένα γονιδίωμα RNA περίπου 7.500 βάσεων θετικής πολικότητας. Μετά από τη μόλυνση του κυττάρου ξενιστή, το γονιδίωμα μεταφράζεται σε μια ενιαία πολυπρωτεΐνη, η οποία υποβάλλεται σε επεξεργασία από τις ιικές πρωτεάσες και μετατρέπεται στις δομικές πρωτεΐνες του καψιδίου και τις μη δομικές πρωτεΐνες, οι οποίες εμπλέκονται κυρίως στην αντιγραφή του ιού. Προκαλούν μια ευρεία ποικιλία οξέων συμπτωμάτων προσβάλλοντας το κεντρικό νευρικό σύστημα, το μυοκάρδιο, τους σκελετικούς μύες, το πάγκρεας, το δέρμα και τις βλεννώδεις μεμβράνες και είναι υπεύθυνοι για την παραλυτική πολιομυελίτιδα, κρούσματα της οποίας απαντώνται ακόμη σε αρκετές υποβαθμισμένες περιοχές του πλανήτη μας. Από αυτή τη σκοπιά η διάγνωση και η καταπολέμησή τους είναι ιδιαίτερης σημασίας. Οι μέθοδοι ανίχνευσης και ταυτοποίησής τους περιλαμβάνουν συχνά χρονοβόρα πρωτόκολλα. Σκοπός της παρούσας εργασίας ήταν να καταρτιστεί ένα πρωτόκολλο κατηγοριοποίησης των 64 οροτύπων των εντεροϊών σε 12 κατηγορίες με βάση την 5 -UTR περιοχή έτσι ώστε να είναι ευκολότερη η προσεγγιστική διάγνωσή τους σε ασθενείς. Η πραγματοποίηση της RT-PCR έδωσε ένα προϊόν ~500 ζεύγη βάσεων το οποίο υποβλήθηκε σε ανάλυση RFLP με το περιοριστικό ένζυμο Hhal. Αντίστοιχη μελέτη έχει ήδη γίνει όσον αφορά τα πρότυπα στελέχη με ιδιαίτερα ενθαρρυντικά αποτελέσματα και στην παρούσα εργασία επιχειρήθηκε η κατηγοριοποίηση άγνωστων κλινικών στελεχών.